却说神农自离开九华山便日夜不停的赶赴陈地，待到得陈地便召集众人说道：“我师欲传我炼丹之术，但此术为圣人所传，不可轻授，你等可随我沐浴斋戒，七天后随我同拜太清圣人，以求圣人传下丹术救我万民。”说完便让人开始修建祭坛，自己也在打坐片刻略恢复元气后便带领众人沐浴斋戒。
  七天后，神农让人在祭坛上摆上混元无极太上人教教主太清圣人太上老君之灵位，灵位前供奉时令鲜果、猪牛羊三牲。神农率众族民拜祭道：“下界弟子人皇神农氏率天下万民叩首顿拜，洪荒万民不识草木丹石之术，病无所医，今弟子率万民在此顿拜，请圣人教主慈悲，传下丹术救我洪荒万民！”
  神农生后众人皆拜道：“请圣人慈悲，救我洪荒万民。”可那灵位却是无有丝毫反应，神农想起老师曾言欲得此术须有诚心，便也不起身一直拜伏于地。众人一直这样从早跪到晚，又又由晚跪倒早，那灵位始终无有一丝反应，众人直跪了三天三夜，除却一些老弱无法持久晕倒之外，其他人皆一直跪于原地。
  突然从三十三天外降下一道清光罩在灵位之上，进而将所有跪拜之人包于其中，众人只觉一股清凉之气从顶上灌下，不但这三天三夜跪拜的困乏一扫而空，而且多年的痼疾也是全部消失。
  众人待清光散去后皆拜谢道：“多谢教主圣人！”清虚见天降祥兆便知大师伯已然同意此时将丹术传于神农便现出身形对刚刚起身的神农说道：“神农，吾奉圣人之命将此丹术传于你，望你用此丹术救治万民，不要辜负太清圣人传你丹术的心意。”说完便将那一卷丹书交给神农，又从袖中将太上老君所炼的丹鼑取出，说道：“此鼎可唤之‘神农鼎’，乃是太清圣人怕你炼丹没有好的炉鼎专门替你所炼。”说着便将神农鼎交给神农。
  神农接过神农鼎后又再次拜谢太上老君赐鼎。清虚见此事已完便对神农说道：“你我以后要再见面却是不知在何时了，望你自己珍重，一切好自为之。”说完便驾祥云而去。神农感念太上老君赐下丹术、炉鼎以救万民，便在人族各部落建太清观，让百姓知道老君的恩德。又念清虚为两代帝师功劳卓着，便命人在陈地修建上清观主祀上请圣人通天教主，清虚道君陪祀，截教之名开始在人族之中传播。清虚却是成为道门二代弟子中第一个扬名洪荒的。
  神农自得到丹书之后便在陈地苦苦钻研，以求早日学会炼制丹药之术，以便传于族人，早点解决困扰族人的病痛。这且不说。此时清虚已然来到轩辕丘，因为此时未来的人皇——公孙轩辕已然出生，清虚要赶在广成子前面收其为徒，以广大截教门户。
  却说在轩辕丘有个人族部落叫——有熊，其部落首领叫少典，少典有两位夫人，其中一位叫附宝。有一天晚上，附宝见一道电光环绕着北斗枢星。随即，那颗枢星就掉落了下来，附宝由此感应而孕。怀胎24个月后，生下一个小儿，少典为之起名叫轩辕。
  轩辕一生下来，就显得异常的神灵。生下没多久，便能说话，族人皆异之。这一日少典正在处理族中之事，突然有人来通报说是被称为两代帝师的仙人清虚道君前来，少典大惊，忙叫那人带路自己前去参拜，通报之人说道清虚道君已在自己家里，少典忙一路小跑跑到自己家中，刚进家门便见一身穿月白道袍，头戴紫金九宫冠的道人正坐于家中，怀中抱着自己的少子公孙轩辕。少典忙上前参拜。
  清虚将其扶起道：“你就是有熊部落的少典？”少典答道：“在下正是。不知仙长驾临此地有何要事。”清虚笑道：“族长不必担心，贫道次来只因族长之子轩辕与贫道有师徒之缘，贫道欲带起上山修炼，不知族长意下如何？”少典闻言大喜想道“清虚仙长收两徒皆为人皇，难道我儿有人皇之命？就算不能为人皇，能得清虚仙长教诲也是天大的机缘啊。”想道此处便说道：“能得仙长收小儿为徒是小儿的福分，在下又怎能不答应。”
  附宝闻言虽然不舍，但附宝也是聪慧之人，知能得清虚道君收为弟子日后必能成为一大才。清虚见少典夫妇已然同意便说道：“那贫道就将其带走了，十五年后贫道便会放其归来。”说完便驾祥云向王屋山飞去。
  第二卷　人族当兴
  →第六章　…　王屋山轩辕下山←
  却说神农自得到丹书之后便开始研习，却不免冷落了家人，神农有个小女儿名叫女娃，最得神农喜爱，却也是非常懂事，他见父亲忙碌便也不去打扰，只和部落中的小孩一起玩耍，一日女娃出门玩耍，却看见一个大孩子把小孩子当马骑。小孩都累爬下了，大孩子还不肯罢休。
  精卫走过去，指着大孩子的脑门怒斥道：〃你这个人太不知羞耻，欺负小孩子算什么本事，有力气，去打虎打熊，人们会说你是英雄。〃
  大孩子见精卫是个小姑娘，生得单薄文弱，根本不把她放在眼里。他从小孩背上跳下来，走到精卫面前说：〃我是海龙王的太子，你是什么人？竟敢来管我！〃精卫说：〃龙王的儿子有什么了不起，我还是炎帝神农的女儿呢，以后你少到陆地上撒野，小心我把你挂到树上晒干。〃龙王的儿子说：〃我先让你知道知道我的厉害，往后少管小爷的闲事。〃说着动手就打。
  不料女娃却是天生不凡，又曾得神农传授上清大法，那龙王太子却不是对手，龙王太子子见打不过精卫，只好灰溜溜地返回大海。过些天，精卫到海中游泳，正玩得十分开心，刚巧让龙王太子发现了。他游过来，对精卫说：哪天在陆地上让你捡了便宜，今天你跑到我家门前，赶快认个错，不然我兴风作浪淹死你。〃精卫倔强地说：〃我没错，认什么错。〃龙王太子见精卫倔强，根本没有服输的意思，立即搅动海水，掀起狂风恶浪，精卫来不及挣扎，就被淹死了。
  精卫死后，变成一只红爪白嘴的小鸟，立志要把大海填平。她用嘴衔来石头与树枝投向大海，并发出〃精卫，精卫〃的叫声，像是在激励自己。她年年月月，永不停歇。那龙太子却是不知此事已为他龙宫埋下了祸根，日后差点让他龙族灭族。
  神农听说女娃掉到海里淹死了极为悲痛便做歌曰：精卫鸣兮，天地动容！
  山木翠兮，人为鱼虫！
  娇女不能言兮，父至悲痛！
  海何以不平兮，波涛汹涌！
  愿子孙后代兮，勿入海中！
  愿吾民族兮，永以大陆为荣！
  神农伤心幼女之死无法视事，容颜也日渐憔悴，众臣民极为着急，却是无法可想。一日有人对神农说道：“您的老师清虚道君乃是有大法力的神人，您为什么不去求他呢？或许清虚道君可以救活女娲也未可知。”神农一听眼前一亮忙驾云来到王屋山求见清虚。
  此时正在上清观内打坐的清虚轻叹一声，睁开双眼对白翎说道：“白翎，你去告诉神农，女娃之事我已知晓，却是女娃命中当有此一劫难，劫数满了自可脱身。”白翎出洞府将清虚所说告诉神农，神农顿时化悲为喜，问道：“老师可说我儿何时可脱劫难？”白翎说：“这个老师倒是未说，想必是时候未到吧。”神农虽说依然有些悲伤，但想到女儿迟早会脱劫，自己父女还有相见之时顿时不是那么悲伤了，忽然想起这些日子因为女娃之事荒废了许多时日，不由暗道一声惭愧，忙向白翎告辞回部落去了。
  神农回到陈地便继续研习丹术，花费数年时间终于在炼丹之术上略有所得，炼制出了一些可以治病的丹药，神农很高兴，将所有自己领悟出来的东西都交给了愿意学的族民。
  清虚自将公孙轩辕带到王屋山之后，便以万年石钟乳为其洗髓阀骨，喝的是琼浆玉液，吃的是灵芝仙果，每日为孔宣讲道时便让白翎将轩辕抱在一边听讲。不过两年时间轩辕便有常人十五六岁大小，清虚便让轩辕每日清晨随孔宣习练武艺，然后与孔宣一起听清虚讲那上清大法，晚上便随清虚学习兵法策略，及农林牧耕之术。
  匆匆十多年时间便过去了，轩辕也长到十五岁了。这一日清虚将轩辕叫来说道：“为师当年与你父相商，你上山学艺十五年便让你下山回家，如今十五年时间已到，你收拾下山去吧。你父乃是轩辕丘有熊部落首领少典。”轩辕问道：“不知弟子何时可再见老师？”“有缘自可相见，修做儿女之态速速去吧！”
  轩辕叩首拜别道：“老师，弟子去了。”说完便出了上清观驾云向轩辕丘飞去，从王屋山到轩辕丘路程虽然颇远，但轩辕这些年受清虚悉心教导，且自身也是天赋异禀，短短十来年时间便已达到天仙道果。从王屋山到轩辕丘不过数天时间便已到达。
  轩辕到达轩辕丘后便直接向族长住处行去，却一时迫不及待的想见到父母，虽然轩辕已然达到天仙境界，但毕竟还是一十五岁少年。轩辕走到族长的屋前对守在门口的部落战士说道：“请这位大哥进去通报一声，就说十五年前离家之人回来了。”
  此时的官员却是还没有后世那许多规矩，那战士虽看轩辕一身道袍有些奇怪，但还是让轩辕稍待，自己进去向族长通告。一会只见从大屋中跑出一群人，有老又少、有男有女。一妇人跑出便将轩辕抱住说道：“我的儿你可回来了，为娘还以为以后再见不到你了。”说完便一阵哭声。轩辕见状便知乃是自己的生母附宝夫人，忙轻声安慰。这时就听见有人说：“好了，轩辕都回来了，附宝你就不要哭了。”轩辕知道这应该就是自己的父亲少典，忙上前拜见。
  少典将轩辕接入屋中便迫不及待的问道：“轩辕，不知清虚仙长交给你什么本事？”轩辕答道：“老师交给我上清仙法，兵书战策以及农林牧耕之术。”少典闻言大喜，说道：“轩辕，为父已经老了，部落中有些事已经力不从心了，你既然从仙长那里学来这么多能耐，那么为父就将这族长之位传与你。”
  轩辕说道：“就怕族人见我年少不服于我。”少典道：“我儿过虑了，清虚仙长乃是两代帝师，你是清虚仙长的弟子，他们有怎么会不服你。”轩辕听父亲如此说便回道：“既然如此那我就接下这族长之位，用老师教授的知识造福族人。”又不由想道：“原来老师在人族中有这么大得名望，一定要好好干出点成绩来，却不能让我将老师的面皮丢了。
  数日后少典便在周围几个部落的见证下将部落首领的位置传给轩辕。
  第二卷　人族当兴
  →第七章　…　祖巫殿蚩尤请刑天←
  轩辕接任族长的位置之后便照清虚所传授的方法，开始教授族人更好的农耕之法。神农教人们将山林焚毁，然后在焚毁的山地上种田，轩辕发现这种方法有时很不好。当人们烧山之时有可能遇上逆风，那样不但山烧不成，而且还会将放火烧山的族人烧死。而且这样的田地耕种数年之后肥力会下降，田里收获的粮食会越来越少，人们就会放其原有的田地，转而继续烧山为田，将山林慢慢的毁去。轩辕发现将人或动物的大小便埋在土中可以提高田地的肥力，这样土地便可以继续使用而不用继续冒着被烧死的危险去烧山为田。轩辕还用清虚所教授的方法来训练部落的勇士，使他们的战斗力增长了很多。周围的部落闻听有熊部落强大且其为帝师清虚道君的弟子，便纷纷率部落归顺，先后有熊、罴、貅、貙、虎、雕、鶡、鹰、鸢九个大部落归顺，使得有熊部落的实力越来越大。轩辕的名声慢慢的传遍了整个洪荒人族部落，神农听说这位师弟的所作所为后非常高兴，常对人说：“有熊部落的公孙轩辕乃是贤者，日后我将效仿伏羲氏将天下共主之位传于轩辕。”
  神农的儿子榆罔听说之后非常不服气，对神农说道：“父亲为人皇，日后人皇之位也当由我继承，他公孙轩辕有何德何能可当天下共主。”这榆罔从小聪明好学，后来习文练武，成长为一位能征善战的大将军。曾有东夷部落之人不服神农管教进犯神农氏东部边境，十七岁的姜榆罔奉命驻守旧都伊川，并且在那里筹建军队，与东夷人作战，多次击败敌人，受到了神农的夸奖和族人的崇拜。
  当时有燧人氏的后代仓颉认为自己乃是圣皇燧人氏的后代且独霸一方，没必要遵从别人为帝，于是拒绝朝拜炎帝，并且率族人东征，神农为增加轩辕的威望便让轩辕率有熊部落的勇士征讨仓颉，轩辕接到神农的命令之后师熊、罴、貅、貙、虎为前驱，雕、鶡、鹰、鸢为旗帜，不过数月时间便击败仓颉，仓颉见轩辕的有熊部落强大，而且轩辕长的器宇轩昂仪表不凡，认为轩辕以