发点完全不同。他认为征服埃及是法国革命理想对愚昧和暴政的胜利——征服是法国的公民权。
  另外，1797年整个春夏，得胜的拿破仑给巴黎的督政府递交了一系列国际政治形势分析。例如5月26日，他鼓励督政府夺取马耳他，称“该岛对我们具有无上的价值，如果我们裹足不前，它迟早会落入英国人之手”。他进一步说明法国新近占领的包括爱奥尼亚群岛和科孚岛在内的岛屿“比整个意大利的价值更大”，不仅因为这些岛屿“资源丰富，商业繁荣”，而且对于支持土耳其盟军有着重要的战略地位。但是，直到9月及10月和蒙日交谈之后，他的想法才得到进一步的充实，提出“为了真正摧毁英国，我们必须占领埃及”（他的冒险计划有点儿自相矛盾，一方面强调支持土耳其帝国的必要性，一方面又计划剥夺该帝国最富有的省份）。在与蒙日讨论之后，拿破仑决定派国库审计员秘密出使马耳他。
  拿破仑在拉什塔特的外交作用逐渐淡化之后，便集中精力埋头致力于制订征服埃及的计划。3月5日，他提交了一份长长的分析远征行动的正式报告，包括他认为需要的兵力配备——25；000名步兵和3；000名骑兵——他认为这就“足以占领埃及和马耳他”了。
  拿破仑的报告只是个形式问题，因为督政府早已和他商量并决定了这件事。同日，督政府颁发了一道法令，宣布发动一场新的军事行动，包括拿破仑提出的成立“地中海海岸军事委员会”指挥征战埃及的军事行动的主张。另一道命令授权对马赛、土伦和其他海港城市的军队进行补充，并组建护送远征军的舰队。同时授权陆军部长调拨100万法郎给新成立的军事委员会，并在此后每隔10天分别给陆军和海军拨款50万法郎直到完成备战为止。另外一道法令命令海军部长在土伦装备战舰，使它们能够胜任3个月的远海作战。督政府在同一天还发布了数道命令，指示驻意大利指挥官在热那亚征调所有船只准备运兵，并命令马塞纳将军立即启程到意大利契维塔韦基亚调兵遣将，同时命令在阿雅克肖的沃比翁将军整装待发。
  虽然这项军事行动的目的是绝密的，连拿破仑的高级将领也只有少数人知道，调兵和运兵计划却在紧锣密鼓之中付诸实施了。
  两天之后，即3月7日，督政府任命布吕埃斯海军中将担任舰队司令，同时继续为远征军准备兵力、弹药和大炮。几天后，贝尔蒂埃被解除其在意大利军的指挥官职务，调回巴黎任远征军参谋长。一周后，路易·德塞①接替了贝尔蒂埃在意大利契维塔韦基亚的职务。
  3月中旬，陆军部长通知法国东部和东南部守军，在他们的军事辖区内将发生大规模的军事调动；他同时命令全法国和法国占领地的所有军事总指挥官向里昂调兵，然后由波恩将军组织和装备这些军队，并用成千上万艘驳船通过莱茵河运到地中海海岸。
  第五章　决定（2）
  督政府对军事行动的目的讳莫如深，以至于从来没有和拿破仑共过事，而现在是远征军指挥官之一的克莱贝尔②至今还不知远征的终极目的地。更让人吃惊的是，海军部长本人直到3月15日还没有被告知远征的真正目的！
  两周后，即3月30日，拿破仑通知法军总审计官（Chief　Army　Ordonnateur和军需司令官的地位、薪酬和重要性相当的一种官职）絮西宣布远征军将由5个师组成，需要两个月的食物和弹药，5个师的兵力分别从5大运兵口岸，即马赛、土伦、热那亚、阿雅克肖以及契维塔韦基亚集结登船，由多马丁将军指挥炮兵；医疗队由18名军医、300多名护士和药剂师组成，由医生德热内特和军医拉雷指挥。拿破仑于3月21日通知“地中海军事委员会”必须在4月9日以前将一切出发工作准备就绪，但各个海港都没有足够的运兵船，更不用说护送的舰只了，大部分船只是临时建造或修修补补的，此外，布吕埃斯海军中将尚在途中，实现计划谈何容易。
  反对这次远征以及心存疑虑的远征军军官大有人在，因此半官方的报纸《箴言报》在4月1日发表的一篇文章上险些泄露了天机，该文称一次“兼有社会和军事性质的远征”　正在成行，“其目的地是埃及。通过埃及进逼英国殖民地印度，要在那里打击英国。”与此同时，大部分拿破仑的军官，甚至连政府的高级官员都仍然被蒙在鼓里。为了弥补这一破绽，并进一步迷惑英国人，4月4日，《箴言报》上刊登了政府公告，称：“拿破仑将军将在10天内启程到布雷斯特担任英格兰方面军指挥官。”
  海军舰队和护卫队显然没有能够按照命令在4月9日出发。在海上执行任务一年多的布吕埃斯的舰队已经离开科浮岛，但是还没有到达。此外，大部分军舰在经过数月的海上航行之后，都需要维修并对大量减员进行补充。尽管如此，当由6艘法国军舰、5艘威尼斯战船和9艘三桅快舰（其中6艘是法国的）组成的破烂舰队终于于4月2日在土伦抛锚停泊时，布吕埃斯仍然受到了热烈的欢迎。
  然而，布吕埃斯和他的舰队所受到的欢迎是短暂的。离家一年多的布吕埃斯刚刚登岸便接到拿破仑和军事委员会的命令：他所指挥的舰队经过补给和载兵之后，必须向未知的目的港，“立即起航不得延误”。雪上加霜的是，委员会还通知布吕埃斯，由于海军经费空虚，无力支付他拖欠舰队9个月的军饷！
  海军中将不顾坐镇巴黎的那些人的决定，坚持舰队需要修整的时间；更有甚者，舰队将补充在沿海强征入伍的士兵。这当然意味着大量未经训练的水手将进行这次远征，尽管有命令“尽量限制外国人”入伍也于事无补。此外，布吕埃斯还做出了非同寻常的决定：清除不称职和不服从命令的海军军官，包括5艘军舰的舰长。还有，布吕埃斯拒绝接受3个月的修整期，坚持要经过6个月的修整之后才能出海征战。训练成千上万强征入伍的水兵是一件麻烦的事。舰队的纪律必须得到维持，布吕埃斯据理力争，现有的对整个舰队中普遍存在的不服从军纪的军官和水兵的惩罚条例过于宽松。革命中诞生的军事法庭陪审团制度应予以取消，应赋予舰长更大的权力，“包括在战争中有权对怯弱者处死的权力”。至于临阵逃脱的水兵，必须“就地予以正法”。对动摇军心者更应严惩不贷。“我们面对着舰只数量3倍于我们的强大而训练有素的敌人，”他用非常逆耳的语言对巴黎的海军领导总结道，“我们打算进行的战役，对我们是有决定性的。要么我们的海军蒙受耻辱，要么我们成为欧洲最强大的海军力量。归根结底，整个远征的胜败取决于压倒对手的制海权。”
  除了海军舰队的组建混乱无序，还有一些非常奇怪的延误因素。例如：拿破仑总司令还要带上法文、希腊文和阿拉伯文的排字模板，远征军里还编入了大量学者，包括天文学家、数学家、博物学家、地理学家、化学家、建筑师、各种东方语的翻译、道路和桥梁工程师，甚至还有一位热气球专家以及一位才艺出众的艺术家。
  成千上万的队伍很快集结于马赛和土伦地区，他们大部分是从莱茵河乘船而来。当军队的主计官从巴黎寻找第一批数百万法郎的薪金支付时，在财政上身无分文的拿破仑下令瑞士占领军从瑞士国库强行提取300万法郎，用船护送到里昂。的确，除了最基本的军需物资，如鞋袜、步枪（在刚补充的12；000枝步枪中就有10；000枝是坏的）、大炮、炸药以及运兵船只等奇缺之外，影响、限制和延误陆军和海军战备的最大因素是没有资金（尽管拿破仑和塔列朗都曾当面保证过资金无虞），仅马赛军港一项就需要耗资5；837；377法郎。同时，刚从契维塔韦基亚过来督促备战的蒙日惊愕地发现调兵的工作几乎停滞不前，他要拿破仑立即拨给250万法郎。在科西嘉也是如此，当地军需部门拒绝合作，除非以前拖欠的经费得到立即支付。法国舰队的情况也好不了多少：他们仍然欠着过去9个月的180万法郎的军饷。布吕埃斯不得不向拿破仑恳求资金。尽管如此，布吕埃斯仍然百分之百地支持拿破仑，不仅对他大加赞扬，而且“保证全力以赴争取远征胜利……效忠共和国政府”。
  第五章　决定（3）
  尽管授权数百万法郎的开支，购买大量军火武器，向地中海沿岸大规模集结兵力，抢修和建造船只，以及强迫征用200艘以上的民船；但是，直到1798年4月12日，督政府才正式签发命令。在卢森堡宫，督政府将这支军队定名为“东方军”，任命“公民拿破仑、现英格兰方面军司令”为东方军统帅；同时下达命令，确认拿破仑率领的这支军队将“进攻埃及并占领这个国家”；同时，命令他“将英国人从他们在东方所占领的地方或其他地方驱逐出去……摧毁他们在红海的商业基地”。他必须“切断（保障）苏伊士运河，采取一切必要手段确保法兰西共和国在红海的利益”，　同时“要和土耳其苏丹保持良好关系……”
  在对奥斯曼帝国的领土作毫无理由的入侵辩解了一番之后，督政府抱怨控制埃及政府的马穆鲁克“与英国有着密切的联系”，并愈来愈依靠英国。其结果，马穆鲁克“对法国人民充满敌意并以恐怖和残忍的手段反对法国人民，每天都对他们寻衅滋事、掠夺和杀害”，因此法兰西共和国迫不得已，只有“全线追捕共和国的敌人”。命令最后说：英国已经完全控制了好望角，法兰西共和国别无选择，只有打开通向“印度”的另一条通道。第三道命令指示拿破仑：基于马耳他对法国人的仇视，以及5年前马耳他拒绝承认新成立的法兰西共和国导致法国在地中海的通航瘫痪，故而这次要占领马耳他。随着这3道命令的秘密“发布”，在督政府看来，整个军事行动已经完全合法，可以放手去干了。
  战争的策划紧锣密鼓地进行着。次日，拿破仑好像觉得远征军的备战事务还不够繁忙似的，又一次向世人展示了他杰出的战略远见，他向督政府献上了一份题为《对英作战的说明》的长长的形势分析报告。在这份报告中，他告诫督政府：虽然入侵英国的计划被搁置起来，但绝不能取消。事实上，他将这个计划视为全球军事战略的重要部分，入侵埃及只是其另一部分而已——其目的都是为了迫使傲慢的英国人坐到谈判桌上来，与法国和平共处。
  东方军总司令的这份令人惊讶的报告，提出法国将在1798年11月从两地登陆：一方面，4万军队从波隆那乘400艘战船出发进攻英国；另一方面，一万军队从被占的荷兰岛屿特塞尔出发进攻苏格兰海岸；与此同时，远征军同时征服埃及。这的确是一个荒谬而不合逻辑的白日梦，为实现这个计划，使法国海军能与英国海军匹敌，拿破仑提出了一个耗资巨大的造船计划，经费高达“4；000万～5；000万法郎”。
  这是个看来显得疯狂的计划——就相对弱小的法国海军而言，要想在英国的殖民地印度、埃及和英国本土同时打击英国是完全不现实的——却不能不说是个十分激动人心的计划。拿破仑认为，只有通过这样一个全球性的军事行动才能挫败英国。但是，拿破仑忽视了英国的海军战略，同时严重忽略了法国海军的训练、军官和水兵较差的素质。这是他整个军事生涯中的一个主要弱点。　他制订针对强敌的横扫千军的作战计划时往往以他的个人愿望为基础，没有也不想去了解或考虑对手的军事实力、自己的不利之处或战略上的问题以及他自己可能出现的失败。
  很难说拿破仑提出这样的冒险计划是多么蛮勇，或是多么不负责任，或是多么疯狂……说到底，他毕竟才只有28岁！考虑到动荡不安的欧洲，与奥地利刚刚签署的和平协定带来的尚不稳定的和平以及英国仍然在欧洲大陆企图组成新的反法联盟，法国没有可能抽回自己边境和海岸的军队和海军力量。拿破仑目前连凑够埃及远征军的38；000人都有困难，到4月15日还差9；000人，更不用说海军征募新兵的问题和运兵船、护卫舰和攻击舰奇缺的问题了。
  最基本的军事装备包括枪支弹药、鞋袜等，对于埃及远征军来说都一直是个问题（拿破仑的正式建议只提计划用兵28；000人）。甚至连面粉供应这样一个简单的问题都有困难：科西嘉由于遭到干旱，水磨房无法运转，大量的小麦无法磨成面粉装船。而且，由于木材缺乏，船只和今后在贫瘠的埃及所用燃料都将是个问题。
  最主要的问题，也是成败的关键问题是——如同布吕埃斯提